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首先從DNA親子鑒定的濱D別發(fā)展來講,親子鑒定從誕生到現(xiàn)在共經(jīng)歷了三個(gè)發(fā)展階段:
個(gè)階段是定分血型鑒定階段,傳統(tǒng)的型區(qū)血清方法能檢測(cè)紅細(xì)胞血型、白細(xì)胞血型、濱D別血清型和紅細(xì)胞酶型等方式,定分通過A、型區(qū)B、濱D別O三種基因型和A、定分B、型區(qū)AB和O型四種表現(xiàn)型之間的濱D別因果關(guān)聯(lián),來分析子女與父母之間的定分親子關(guān)系。但由于血型中遺傳標(biāo)志均為基因編碼的型區(qū)產(chǎn)物,多態(tài)信息含量(PIC)太少,濱D別不能反映DNA編碼區(qū)的定分多態(tài)性,而且遺傳標(biāo)志存在生理性、型區(qū)病理性變異(如A型、O型血的人受大腸桿菌感染后,B抗原可能呈陽性這樣的情況,因此容易失活導(dǎo)致檢驗(yàn)結(jié)果不準(zhǔn)確,不足以判定親權(quán)關(guān)系;
第二個(gè)階段是STR(Short tandem repeats)又稱SSR階段,即短串聯(lián)重復(fù)序列,又稱微衛(wèi)星DNA(micro satellite DNA),以串聯(lián)的短序列重復(fù)為標(biāo)志,在不同的生物中串聯(lián)的重復(fù)次數(shù)不同,表現(xiàn)為個(gè)體1.ATATATATAT 個(gè)體2.ATATATATATATATAT,利用少量的STR位點(diǎn)就可以計(jì)算親權(quán)系數(shù),位點(diǎn)越多,計(jì)算越,一般采用16或者21個(gè)位點(diǎn)來參與計(jì)算。該技術(shù)雖然目前還被廣泛應(yīng)用,但親子鑒定中常會(huì)發(fā)生STR突變的情況,突變對(duì)親子關(guān)系的判定會(huì)造成困擾;
第三個(gè)階段是SNP(單個(gè)位點(diǎn)的核苷酸突變)階段,又稱單核苷酸多態(tài)性鑒定技術(shù),表現(xiàn)為個(gè)體1.ATCTGG個(gè)體2.ATGTGG,是誕生的一種親子鑒定技術(shù),結(jié)合新一代測(cè)序技術(shù),可以通過大量SNP基因位點(diǎn)的計(jì)算來判定親屬關(guān)系。單核苷酸多態(tài)性(SNP)作為第三代遺傳標(biāo)記,在遺傳制圖、連鎖性分析、疾病基因定位和物種多態(tài)性研究等諸多領(lǐng)域中,SNP已經(jīng)逐漸取代STR,成為的遺傳標(biāo)記。
DNA親子鑒定STR分型與SNP分型區(qū)別:
通過上面對(duì)DNA親子鑒定的發(fā)展的介紹,大家對(duì)STR分型與SNP分型有一定的了解,下面我就來總結(jié)一下,STR廣泛存在于人類基因組中的DNA多態(tài)性基因座.它由2~6堿基對(duì)構(gòu)成核心序列,呈串聯(lián)重復(fù)排列,STR基因位點(diǎn)長度一般在100~300 bp之間,因個(gè)體間DNA片斷長度或DNA序列差異而成高度多態(tài)性,在基因傳遞過程中遵循孟德爾共顯性方式遺傳;SNP是在基因組水平上由單個(gè)核苷酸的變異所引起的一種DNA序列多態(tài)性。這種變異可由單個(gè)堿基的轉(zhuǎn)換(transition)或顛換(transversion)所引起,也可由堿基的插入或缺失所致。SNP是人類可遺傳的變異中常見的一種,也是基因組中為穩(wěn)定的變異,占所有已知多態(tài)性的90%以上。任何一個(gè)群體中頻率不低于1%的SNP位點(diǎn)大約有1000萬個(gè),占總的SNP位點(diǎn)的90%。SNP限度地代表了不同個(gè)體之間的遺傳差異。
第三代DNA鑒定技術(shù)SNP分型相對(duì)于STR分型有那些優(yōu)勢(shì):
1.作為遺傳標(biāo)記,SNP比STR更為穩(wěn)定,STR序列的突變率高于人類基因的平均突變率,而且STR中存在著多個(gè)核心序列重復(fù)、核心序列的非整倍重復(fù)等現(xiàn)象,SNP則不存在這類問題;
2.SNP檢測(cè)比STR檢測(cè)對(duì)DNA樣本的要求更低,適應(yīng)更多的特殊環(huán)境,SNP是單堿基圖片,在PCR過程中一般只需擴(kuò)增1OObp左右的長度即可完成檢測(cè),如在極端溫度與濕度的影響下,DNA會(huì)降解,很難收集到足夠的STR數(shù)據(jù),象9.11災(zāi)難很多遇難人員身份識(shí)別用STR沒辦法確認(rèn),就是通過SNP實(shí)現(xiàn)的;
3.相對(duì)于STR,SNP的檢測(cè)樣本成本更低,且通量更高;
4.在父母與子女之間的親緣關(guān)系鑒定方面,十幾個(gè)位點(diǎn)的STR鑒定系統(tǒng)能夠提供充分的信息,但當(dāng)鑒定的需求擴(kuò)充到更遠(yuǎn)的親緣關(guān)系,如表親的樣本鑒定時(shí),STR位點(diǎn)鑒定提供的信息則不足以支撐鑒定結(jié)果,而SNP位點(diǎn)由于具有遠(yuǎn)超過STR位點(diǎn)的數(shù)量,可以提供更多的信息,理論上能夠?qū)苓h(yuǎn)的親屬關(guān)系也提供可信的判定;
簡單來說STR分型比SNP分型對(duì)樣本要求高,相對(duì)應(yīng)的樣本信息含量也高,STR遺傳標(biāo)記是重復(fù)序列為2-5個(gè)核苷酸,含有多個(gè)等位基因,SNP遺傳標(biāo)記多數(shù)為二等位基因,堿基替換或顛換,這就是為什么SNP更穩(wěn)定,對(duì)樣本要求低且檢測(cè)成本低的原因;STR遺傳標(biāo)記可復(fù)合擴(kuò)增15-20個(gè)位點(diǎn),SNP遺傳標(biāo)記復(fù)合擴(kuò)增50個(gè)以上的位點(diǎn),這也是為什么SNP能夠?qū)Ρ碛H這樣的親屬關(guān)系進(jìn)行鑒定。
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(作者:新聞中心)